Disinfection in Healthcare

Peter Hoffman, Graham Ayliffe, Tine Bradley

ارائه ی یک مدل داده مناسب برای کشف انتقال بیماری های ژنتیکی word

فهرست مطالب

چکیده

فصل اول: مقدمه1

1-۱ پیشگفتار2

1- ۲ بیان مسئله3

1-3 اهمیت وضرورت انجام تحقیق6

1-4 جنبه جدیدبودن ونوآوری درتحقیق7

1-5 اهداف مشخص تحقیق8

1-6 مروری برساختارپایان نامه8

فصل دوم: مفاهیم9

2-1 مقدمه10

2-2 مدل داده چیست؟10

2-2-1 مدل های داده ساخت یافته12

2-2-1-1 مدل داده رابطه ای12

2-2-1-2 مدل داده شی گرا14

2-2-1-۳ مدل داده شی رابطه ای16

2-2-2 مدل داده ای غیرساخت یافته17

2-2-2-1 مدل داده ای کلید/ارزش19

2-2-2-2 مدل داده ای سندگرا21

2-2-2-3 مدل داده ای ستونی23

2-2-2-4 پایگاه داده های گراف24

عنوان صفحه

2-3 مدیریت داده ها29

2-4 داده های پزشکی30

2-5 کاربردهای مدیریت داده های پزشکی34

2-6 بیماری های ژنتیکی36

2-7 انتقال بیماریهای ژنتیکی37

2-8 آزمایشهای ژنتیکی38

فصل سوم: پیشینه تحقیق42

3-1مقدمه43

3-2 مدل داده رابطه ای برای بیماریهای همه گیری43

3-3 مدل داده شی رابطه ای برای بیمارستانها44

3-4مدل داده گرافی برای بیماری های همه گیری47

فصل چهارم: روش پیشنهادی48

4-1مقدمه49

4-2 موجودیتها53

4-3-صفات مربوط به هریک ازموجودیتها53

4-3-1انسان سالم53

4-3-2انسان ناقل54

4-3-3 انسان درمان شده54

4-3-4 انسان بیمار54

4-3-5پزشک55

عنوان صفحه

4-3-6بیماری55

۴-۳-۷علائم57

4-3-8 روشهای درمان58

4-3-9 دارو58

4-4مقادیرذخیره شده برروی یالها59

4-5تعیین قابلیتهای مدل داده60

4-5-1ایجادکردن60

4-5-2افزودن61

4-5-3به روزرسانی61

4-5-4حذف کردن61

4-5-5پرس وجو62

4-5-5-1پرس وجوهای وابسته به یک گره62

4-5-5-2پرس وجوهای مربوط به دوگره66

4-5-5-3پرس وجوهای بیش از دوگره68

4-6طراحی مدل داده70

۴-۶-۱ طراحیER70

۴-۶-۲ طراحی مدل گرافی72

فصل پنجم: ارزیابی75

5-1 مقدمه76

5-2 روش اول: گروه متمرکز77

۵-۲-۱ آشنایی باگروه متمرکز77

عنوان صفحه

۵-۲-۲ مزایای گروه متمرکز77

۵-۲-۳روش شناسی گروه متمرکز77

۵-۲-۴ ارزیابی به وسیله ی گروه متمرکز79

5-3 روش دوم: پیاده سازی عملی پایگاه داده79

5-3-1 نرم افزارنئوفرجی80

5-3-2 داده های موردنیاز80

5-3-3 ذخیره داده هادرپایگاه داده نئوفرجی81

5-4 نتایج83

فصل ششم:جمع بندی و کارهای آتی90

6-1 جمع بندی وکارهای آتی91

منابع97

 فهرست جدول ها

عنوان صفحه

جدول (3-1) : پایگاه داده ی سنتی رابطه ای45

جدول (3-2) : پایگاه دادهEAV45

جدول(3-3) : یک شمای کلیازEAV46

جدول (5-1 ): زمان مربوط به پرس وجوهای مختلف85

 فهرست نمودارها

عنوان صفحه

نمودار(۵-۱) پرس و جوهای یک گره..............................................................................................86

نمودار(۵-۲) پرس و جوهای دو گره...............................................................................................87

نمودار(۵-۳) پرس و جوهای سه گره..............................................................................................87

نمودار(۵-۴) پرس و جوهای تمام گره ها.......................................................................................88

نمودار(۵-۵) مقایسه کمترین-بیشترین و میانگین زمان پرس و جوها..............................................89

 فهرست شکل ها

عنوان صفحه

شکل(2-1 ) نمونه ای اولیه از پایگاه داده گراف.............................................................. ..............27

شکل(3-1)پیاده سازی بیماری همه گیری با پایگاه داده رابطه ای...................................................44

شکل(3-2)یک پیاده سازی ساده از EAV/CR...............................................................................46

شکل (3-3) پیاده سازی بیماری همه گیری با پایگاه داده گرافی..................................... .............47

شکل (4-1) نمودارER....................................................................................................... ..........71

شکل (4-2) پایگاه داده گراف طراحی شده برای بیماری های ژنتیکی..........................................74

شکل(5-1) نمایش تمام گره ها روابط در پایگاه داده گرافی..........................................................82

چکیده

در جامعه امروزی با توجه به پیشرفت علم پزشکی حجم داده­های پزشکی به سرعت در حال افزایش هستند. برای تحلیل سریع­تر و کارآمدتر این داده­ها نیاز به ذخیره الکترونیکی این داده­ها داریم. داده­های مربوط به بیماری­های ژنتیکی نیز از این دسته داده­ها به حساب می­آیند. با توجه به این مسئله می­بایست پایگاه داده­ای مناسب ذخیره و بازیابی این داده ها طراحی نماییم. با توجه به ماهیت داده های ژنتیکی و این مسئله که در مورد انتقال بیماری های ژنتیکی روابط بین افراد و تجزیه تحلیل آن مسئله مهمی به حساب می­آید در این مقاله برای ذخیره و بازیابی این داده­ها از مدل داده­ی گرافی که یکی از زیر مجموعه­های مدل داده­های غیر ساخت یافته (NOSQL)است استفاده می­نماییم. برای این کار ابتدا نیازها و پرس و جوهای مربوط به این مسئله را مشخص می­کنیم و بر اساس آن مدل داده گرافی را طراحی می­نماییم. برای ارزیابی مدل داده طراحی شده یک تیم متشکل از متخصصان ژنتیک نیز این مدل داده را بررسی کرده و نظر مساعد خود را در خصوص کاربرد این مدل داده برای بیماری های ژنتیکی بیان نمودند. هم­چنین از نرم افزار Neo4j استفاده نمودیم که داده­های مربوط به بیماری ژنتیکی تالاسمی را در آن ذخیره کرده و این مدل داده را بر اساس کارایی ذخیره سازی و بازیابی اطلاعات و زمان پرس و جوها مورد بررسی قرار دادیم که با توجه به زمان پرس و جوها و عدم پشتیبانی سایر مدل داده­ها از روابط بین افراد، این مدل داده مدل مناسبی به شمار می­آید.

کلمات کلیدی: ژن،بیماری های ژنتیکی، پایگاه داده های گرافی،neo4j،مدل داده

فصل اول: مقدمه

  1-۱-پیشگفتار

در زمینه پزشکی داده­ها به سرعت در حال تولید وگسترش هستند. این داده­ها در اشکال متفاوت­تری نسبت به داده­های گذشته تولید می­شوند و با توجه به پیشرفت­های علم در این زمینه نیاز به مدیریت­های جدید بسیار بیشتر از گذشته احساس می­شود.­­ برای ذخیره این داده­ها پایگاه­داده­ای که قادر به پشتیبانی از انواع مختلف داده­ها و حجم زیاد داده­ها باشد و همچنین توانایی انجام مدیریت صحیح و کامل داده­ها را دارا باشد، نیاز داریم]14[.

در خصوص بیماری­های ژنتیکی داده­هایی که نیاز به ذخیره آن­ها داریم، داده­های متنوعی هستند. با توجه به ماهیت بیماری­های ژنتیکی برای درک نحوه انتقال این بیماری­ها نیاز به ذخیره وضعیت سلامتی اجداد بیماران نیز داریم که در هر بررسی ممکن است فرد جدیدی به این شجره نامه اضافه شود، همچنین برای کشف مسیر انتقال بیماری­ها روابط بین افراد در این پایگاه­داده بسیار مهم و ضروری می­باشد. برای پشتیبانی از این نیازها و مدیریت روابط بین افراد و انتقال بیماری، پایگاه­داده­های ساخت­یافته[1]گزینه مناسبی نیستند، زیرا قادر به پشتیبانی از انواع مختلف داده ها نمی­باشند.

پایگاه­داده­های غیرساخت­یافته[2]برای پشتیبانی انواع مختلف داده ها گزینه های مناسب­تری هستند. پایگاه­داده هایNOSQLانواع مختلفی دارند اما با توجه به این که در این نوع بیماری روابط بین افراد بسیار مهم است و همچنین باید در هر زمانی قادر به افزودن موجودیت ها باشیم پایگاه­داده های گرافی مورد مناسبی می­باشند.

 1-۲-بیان مسئله

بدن انسان­ها از تریلیون سلول تشکیل شده و هر سلول دارای یک هسته می­باشد. هسته سلول­ها از تعداد 46 کروموزوم یا23جفت کروموزوم تشکیل شده است. کروموزوم­ها دارای رشته­های در هم پیچیده­ای به نامDNAهستند که اینDNAها شامل ژن­ها هستند.هر سلول بدن انسان­ها شامل25000تا35000ژن است]1[.

ژن­ها دارای اطلاعاتی هستند که این اطلاعات ویژگی­های انسان را می سازد.ژن­ها ازترکیب پایه­ای به نام نوکلئوتید تشکیل شده­اند. ترکیب پایه از4­­ساختار تشکیل شده است"ادنینA[3]/گوانینG[4]/سیتوزینC[5]/ تیمینT[6]"در حقیقت برای بیان هر ژن از4حرفA,T,C,Gاستفاده می­کنیم که اصطلاحا به آن توالی نوکلئوتیدی گفته می­شود.

توالی ژن­های مربوط به بیماری­ها در بدن انسان­های نرمال به یک شکل است و بیماری زمانی اتفاق می افتد که در این توالی تغییری ایجاد شود.البته طول توالی نوکلئوتیدی بیماری­های مختلف با یکدیگر متفاوت هستند.به طور مثال طول توالی ژن انسولین333کاراکتر است.تا کنون بیشترین طول توالی نوکلئوتیدی شناخته شده مربوط به بیماری دوشن می­باشد.طول این توالی2.3مگا می­باشد.

به عنوان مثال­هایی از بیماری­های ژنتیکی می­توان از زالی، سرطان های پوست، عقب افتادگی­ذهنی، کم خونی داسی شکل، فنیل کتونوری، تالاسمی و نظایر آن نام برد]2[.

برخی از مواردی که بررسی­های ژنتیکی انجام می­پذیرد به شرح ذیل است:

• زوجی که قصد تشکیل خانواده دارند و یکی از آن­ها یا یکی از خویشان نزدیک او دچار بیماری ارثی است.
• فردی که فرزندی با یک نقص مادرزادی حاد دارد.
• کودکی با یک مشکل جسمی که می‌تواند ژنتیکی باشد.

برای انجام این تست­های ژنتیکی در وهله اول نیاز به داشتن شجره­نامه زوجین در هنگام تشکیل خوانواده، والدین در هنگام تست­های بارداری و بیمار در هنگام بررسی یک بیمار ژنتیکی داریم. پس از دانستن شجره­نامه در هنگام برخورد با بیماری­ها نیاز به ذخیره اطلاعاتی درباره بیمار داریم.

برای ذخیره داده­های مربوط به بیماری­های ژنتیکی نیاز به پایگاه­داده­­ای داریم که بتواند به خوبی از ذخیره انواع داده ها پشتیبانی کند.برای این داده ها نیاز به مدل­داده­ای داریم که بتواند علاوه بر ذخیره این داده­ها به بررسی و تجزیه تحلیل این داده­ها بپردازد.یکی از مسایل مهم برای انتخاب مدل ­داده این است که در مورد داده­های پزشکی برای هر بیمار ممکن است خصوصیاتی را ذخیره کنیم که برای دیگر بیماران نیازی به آن نداشته باشیم مثلا ممکن است برای یک بیمار نیاز به ذخیره جواب آزمایش خون داشته باشیم اما برای بیمار دیگر نیاز به انجام این تست و ذخیره این آزمایش نداشته باشیم و یا ممکن است در حین بررسی شرایط بیمار به مواردی برخورد کنیم که از ابتدا پیش بینی نشده بود،به این دلیل بهتر است از ابتدا یک طرح کلی برای پایگاه­داده طراحی نشود تا بتوانیم هر خصوصیتی را که نیاز داشتیم یا در حین کار با آن مواجه شدیم برای بیمار اضافه کنیم.با توجه به این موضوع به این نتیجه می رسیم که از پایگاه­داده های SQLنمی­توانیم استفاده کنیم و پایگاه­داده های NOSQLبرای این امر مناسب­تر هستند.

مسئله مهم دیگر این است که با توجه به نیاز به ژنتیک اعضای خانواده و نسل­های قبل بیمار باید توانایی افزودن موجودیت­ها(نسل های قبل و بعد)ی جدید را در حین انجام تحقیقات به این پایگاه­داده داشته باشیم. در مورد انتقال بیماری­ها تشخیص مسیر انتقال بیماری اهمیت ویژه­ای دارد زیرا باید مشخص شود که بیماری از پدر یا مادر،در مرحله بعد از کدام یک از اجداد به ارث رسیده و همینطور تشخیص داده شود که این بیماری ممکن است به کدام یک از فرزندان دختر یا پسر به ارث برسد. به این دلیل باید پایگاه­داده­ای طراحی کنیم که قابلیت استخراج روابط بین موجودیت­ها را دارا باشد. البته روابط بین موجودیت­ها در پایگاه­داده­های رابطه­ای نیز قابل استخراج است اما اولا به دلیل نیاز به نوشتن رویه­های تو­در­تو امر بسیار پیچیده و زمان بر است ثانیا در مدل­داده گراف می­توانیم بر روی یال­ها نیز خصوصیاتی را برای ارتباط موجودیت­ها تعریف کنیم. با توجه به این سه مسئله به این نتیجه می­رسیم پایگاه­داده گرافی بهترین انتخاب برای این نوع بیماری ها است.

در این پایان­نامه با استفاده از مدل­داده گراف پایگاه­داده­ای را طراحی خواهیم کرد که توانایی ذخیره انواع و حجم­های مختلف داده را دارا باشد. پایگاه­دادهطراحی شده باید قابلیت انجام عملیات برروی این داده های ذخیره شده را داشته باشد و بتواند نتایج مورد نظر در بررسی انتقال بیماری­های ژنتیکی را ازآن استخراج کند. نتایجی مانند مسیر انتقال بیماری،امکان انتقال بیماری به نسل بعد یا امکان انتقال بیماری به جنسیت خاصی از نسل بعد، درصد انتقال بیماری و ...

در این پایـگاه­داده موجودیت­ها که همان افراد هستند درون گره­ها ذخیره می­شوند، در گره­ها علاوه

بر مشخصات عمومی بیماران تمام اطلاعات مربوط به بیــماری افراد، شرایط و علائم بیماران نیز ذخیره

می­شوند. در سطوح بعدی گراف، نسل­های بالاتر بیماران همراه با اطلاعات مربوط به بیماری مخصوصی

که در حال تحقیق در مورد آن هستند ذخیره خواهد شد. برای نمایش روابط بین افراد در این مدل­داده از

یال­ها استفاده خواهیم کـــرد. به این صورت که اگر بیماری از شخصی به شخص دیگری انتقال یافت از

یال جهت­دار برای نمایش این انتقال استفاده خواهیــم کرد. علاوه بر این­ها می­تـــوانیم بر روی یال­هـــا

توضیحاتی را نیز اضافه نمائیم. توضیحاتی مانند درصد احتمال انتقال یک بیماری خاص از یک فرد به­فرد

دیگر.

The encyclopedia of applied linguistics

Carol Chapelle

گزارش تخصصی دروس دوره ی ابتدایی (۲۳صword)

عنوان: گزارش تخصصی دروس دوره ی ابتدایی

صفحات: ۲۳ صفحه

فرمت: word

شامل: مقدمه،توضیحات مربوط به هر قسمت می باشد.

هزینه دانلود: انتهای صفحه

  -------------------

قسمتی از گزارش تخصصی دروس دوره ی ابتدایی :

...  چند نفر از معلمین را می شناسید که درکلاس های درسشان بصورت کلیشه ای پاسخ سئوال نمی دهند و آن ها را در تصحیح اشتباهاتشان مستقیماً هدایت نمی کنند ؟ دوره ی ابتدایی
چند درصد از دبیران و معلمان را می بینید که فرصت گفت و گوی کلاسی را با طرح سئوالات هدایت شده برای فراگیران ایجاد کنند ؟ ( بویژه دروس خاص )
چند درصد از معلیمن کلاس های پرجنب و جوش و پرنشاط را برمی تابند ؟ ( اکثراً کلاس را تحمل و کنترل می کنند ) دوره ی ابتدایی
آیا علت خستگی های معلیمن مان را بررسی کرده اید ؟ شاید این موارد را هم باید مرور کنیم که : صحنه گردان کلاس هایمان معلمین هستند ، کنترل دانش آموزان برای آرامش و سکوت و.. دوره ی ابتدایی
فکر می کنید چند درصد از معلمین  دوره ی ابتدایی طرح درس روزانه ، هفتگی و سالانه دارند و از آن استفاده می کنند ؟ ( چند درصد با طرح درس آشنایند و رعایت زمانبندی درس و کلاس را به درستی انجام می دهند ؟ )
چند درصد از معلمین گرامی تدارک فعالیت های تدریس از جمله : انتخاب مواد آموزشی مناسب را برای ایجاد انگیزه و ارائه ی محتوای درسی می بینند ؟
آیا معلمین عزیز از امکانات و وسایل و تجهیزات رسانه ای و سمعی و بصری برای تدریس خود استفاده می کنند ؟ و چند درصد از ایشان با استفاده از این وسایل آشنایی دارند ؟ دوره ی ابتدایی و... (معلمین گرامی باید به شناسایی و ارتقای مهارت‌های خود در کاربرد فناوری‌های نوین نظیر ICT و IT در آموزش بپردازند)
چند درصد از معلمین ما به مسائل ریز و مهم لباس و آرایش و نوع سخن گفتن و... خود دقت نظر دارند ؟ ( توجه و ظواهر امرمعلمی ) دوره ی ابتدایی
آیا می دانیم شایسته سالاری معلم در کلاس درس  دوره ی ابتدایی یعنی ؛ توجه به هنر ، اخلاق و ادب ، فن بیان ، ارتباط با قرآن و اهل بیت و ... ( چند درصد از معلمین ما این ویژگی ها را دارند ؟ )
ارزشیابی توصیفی
منظور از روش های توصیفی در ارزشیابی توجه به رویکردی است که در آن معلم تغییرات و تحولات ایجاد شده در دانش آموز را با فنون متفاوت بررسی کرده و به صورت مشروح بر اساس شاخصهای پیشرفت و یا اهداف از پیش تعیین شده به اطلاع دانش آموز و والدین می رساند. دوره ی ابتدایی
با بررسی های کارشناسان و صاحب نظران طرح ارائه نمره ی صرف ، ضمن ایجاد رقابت و اضطراب، یادگیری و پیشرفت تحصیلی دانش آموزان را تحت الشعاع قرارداده و با ایجاد افسردگی، بخش زیادی از منابع و استعدادهای با لقوه انسانی و اقتصادی را تلف می نماید. برخورد معلمان و والدین و ارزش بیش از حد قائل شدن به امتحان و تکرار بیهوده آن و استفاده ابزاری از آن باعث ایجاد دلسردی از تعلیم و تربیت و امتحان با این سبک و سیاق، نقطه پایان یادگیری و نوعی رهایی از درس و تحصیل محسوب می شود . دوره ی ابتدایی
اساس طرح ارزشیابی توصیفی « ارزشیابی کیفی » با اهدف زیر مطرح و مصوب گردید:
حذف نمره ، بوجود آوردن تجربه ی نو آوری برخاسته از عمل ، بهبود کیفیت یاددهی و یادگیری ، تاکید براهداف آموزش و پرورش به جای محتوای صرف ، توجه به روش های یادگیری موثر و کیفیت یادگیری ، دوره ی ابتدایی بهبود و اصلاح شیوه های ارزشیابی ، کاهش اضطراب دانش آموزان ، بالا بردن مهارت های زندگی ، توصیف و قید تمامی مهارتها و نگرش های دانش آموزان به غیر از فعالیت های آموزشی در کارنامه ها و افزایش بهداشت روانی محیط یاددهی و یادگیری و کاهش فشارها.
آنچه قابل تامل است : دوره ی ابتدایی
فقدان نگاه نظامند به آموزش و پرورش و برنامه درسی و ارزشیابی توصیفی .
عدم برنامه ریزی منسجم و قانون مند در حذف بازخورد نمره برای بسیاری از معلمان ، بویژه معلمان با سابقه . دوره ی ابتدایی
یقیناً که ارزشیابی توصیفی با ابزارهای در اختیار معلمین می تواند اطلاعات بیشتر و وسیع تری را برای معلم آماده سازد و اعتبار این اطلاعات به قضاوت منصفانه ی آن ها بسیار کمک می کند ، اما آیا می دانید برای تهیه ی این ابزار که از جمله پوشه کار ، ابزار ثبت مشاهدات ، تکالیف درسی و آزمون های عملکردی ، کانامه ی ارزشیابی توصیفی و ... دوره ی ابتدایی می باشد چه هزینه ها و چه دردسرهایی را برای خانواده ها بوجود می آورد ؟ چرا که تقریباً تمام مدارس ایران کلیه ی هزینه های آموزش و پرورشی را بر عهده ی والدین قرار می دهند ( و این مغایر با موضوع آموزش رایگان برای همه می باشد ) ( تحمیل فشارهای ناخواسته از سوی کلاس و مدرسه به خانواده ها ) دوره ی ابتدایی
پس از گذشت چندین سال از اجرای این طرح هنوز اکثر خانواده ها و چه بسا برخی از معلمان با آن آشنایی ندارند .
کارنامه ها در ارزشیابی توصیفی به سبب جامع نگری که دارند ، دوره ی ابتدایی شامل همه ی داده های کمی و کیفی دانش آموزان می گردند و این تحلیل و ترکیب داده ها و تصمیم گیری آموزشی و تربیتی مبتنی بر ارتقاء یا عدم ارتقاء دانش آموزان را آسان می کند . دوره ی ابتدایی اما از شما سئوال می کنم : چند نفر از دانش آموزان منطقه یا شهر شما طی این چند سال بر اساس ارزشیابی توصیفی ضعیف شناخته شده و می بایست آن واحد های درسی افتاده را در سال بعد تکرار کنند ؟ ( همه قبولند !!! یعنی ما در مقطع ابتدایی نه افت تحصیلی داریم و نه دانش آموز ضعیف >>>>>> حال آنکه معلمین می بایست بی کم و کاست به درصد قبولی حد اکثری بیاندیشند .) دوره ی ابتدایی
آیا واقعاً معلمین ما توجه همه جانبه به تمامی جنبه های رشد" را به عنوان یک محور مستقل از الگوی ارزشیابی توصیفی رعایت می کنند و می دانند . دوره ی ابتدایی

 لطفا برای خرید و دانلود به انتهای صفحه مراجعه نمایید.

 جهت پشتیبانی

و جهت طرح سوال، پیشنهاد یا انتقاد

می توانید از قسمت تماس باما،

پیام خود را برای ما ارسال نمایید.

در اولین فرصت، پاسخگوی شما دوست عزیز خواهیم بود.

 بهترین ها حق شماست.

دوره ی ابتدایی

گزارش تخصصی دروس دوره ی ابتدایی

Adhesives and Adhesive Tapes

Gerhard Gierenz, Werner Karmann